Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gfra2O08842 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms