Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm8050L7N2E3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms