Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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