Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2056J3QQ02 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms