Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm2035J3QP87 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms