Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm20795J3QP49 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gm20795J3QP49 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gm20795J3QP49 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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