Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp616J3QN14 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms