Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20873J3QMQ9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gm20873J3QMQ9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gm20873J3QMQ9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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