Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm3336J3QMQ6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3336J3QMQ6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms