Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
7530416G11RikJ3QJX6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms