Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcf11G3X9Z4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcf11G3X9Z4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms