Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms