Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9a3G3X939 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc9a3G3X939 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms