Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim55G3X8Y1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim55G3X8Y1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms