Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm17455G3UW87 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm17455G3UW87 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm17455G3UW87 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17455G3UW87 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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