Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms