Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Farp1F8VPU2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms