Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M1F7CXU4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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H2-M1F7CXU4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M1F7CXU4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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