Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm28038F7BCN9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28038F7BCN9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms