Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28048F7BCN0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28048F7BCN0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms