Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms