Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngap1F6SEU4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngap1F6SEU4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms