Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Herc6F2Z461 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Herc6F2Z461 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Herc6F2Z461 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Herc6F2Z461 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Herc6F2Z461 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Herc6F2Z461 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc6F2Z461 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc6F2Z461 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc6F2Z461 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms