Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cald1E9QA15 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms