Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tarbp1E9Q368 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp1E9Q368 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms