Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lrp3E9Q1T6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lrp3E9Q1T6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lrp3E9Q1T6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lrp3E9Q1T6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lrp3E9Q1T6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lrp3E9Q1T6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lrp3E9Q1T6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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