Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms