Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms