Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scaf11E9PZM7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf11E9PZM7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms