Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd1E9PZ26 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms