Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9008E9PVG0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms