Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde2E9PUP1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms