Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms