Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms