Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6685D3YYP3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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