Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Kif28pD3YXS5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kif28pD3YXS5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms