Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SafbD3YXK2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms