Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd1D3YXK1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd1D3YXK1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms