Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms