Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc13D3YV10 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms