Protein–RNA interactions for Protein: D2EAC2

Zbed6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed6D2EAC2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed6D2EAC2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms