Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mterf1bB9EJ57 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf1bB9EJ57 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms