Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clip3B9EHT4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms