Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apol6B7ZC55 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms