Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabrr3B2RXA8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabrr3B2RXA8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms