Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms