Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Siah3B2RWG3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms