Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms