Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

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Length 589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AU022751B1B0V2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU022751B1B0V2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AU022751B1B0V2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU022751B1B0V2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU022751B1B0V2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU022751B1B0V2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU022751B1B0V2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU022751B1B0V2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AU022751B1B0V2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU022751B1B0V2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU022751B1B0V2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU022751B1B0V2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU022751B1B0V2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU022751B1B0V2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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