Protein–RNA interactions for Protein: B1AYN9

Tex28, Testis-expressed 28, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tex28B1AYN9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tex28B1AYN9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tex28B1AYN9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms